Свое название остров получил в честь дочери венгерского короля Белы IV – Маргит. Когда Венгрию захватили татаро-монголы под предводительством хана Батыя, король Бела дал обет отдать своего первого ребенка в услужение Богу в случае избавления страны от нашествия. Бог услышал королевские молитвы и прибрал к рукам зловредного Батыя. Осиротевшие татары ушли из Венгрии, и король сдержал свое слово: построил на острове монастырь и отправил туда свою дочь Маргариту. В красавицу потом влюбился чешский король и вымолил разрешение на освобождение Маргит, но девушка отказалась и осталась жить в добровольном заточении вплоть до 28 лет – до самой смерти. Позже Маргит причислили к лику святых и назвали остров ее именем.