Национальный антропологический музей был основан в марте 2007 года, после проведения передвижной выставки «Человек в прошлом», организованной Институтом экспериментальной морфологии и антропологии и прошедшей с огромным успехом. Директором этого уникального музея является профессор антропологии Йордан Йорданов - один из немногих ученых-антропологов в мире и единственный в Болгарии специалист, занимающийся реконструкцией лица человека на основе его черепа.
В коллекции Национального антропологического музея собрано большое количество восстановленных образов людей, живших на Земле в различные исторические эпохи. В одном из залов музея можно увидеть процесс восстановления личности человека при проведении подобной реконструкции.
При музее существует костехранилище, в котором собраны все антропологические материалы, найденные при проведении археологических раскопок. Эта бесценная коллекция позволяет специалистам проводить научные изыскания и исследовать останки людей.
Экспозиция Национального Антропологического музея расположена в хронологическом порядке: представлены эпохи Праистория, Античность, Средневековье и Болгарское Возрождение.
Интересна экспозиция, представляющая восстановленные лица, реконструированные по найденным при раскопках останкам людей и воссоздающие эволюцию черт лица человека и их постепенную грацилизацию - эволюционный процесс, характеризующийся постепенным изменением лицевых костей.
Посетителям музея будет интересно увидеть реконструированные образы: жреца, останки которого были обнаружены при проведении археологических раскопок Варненского некрополя; фракийской принцессы, останки которой были найдены в Могиланском кургане близ города Враца; болгарских царей Калояна (1168–1207) и Самуила (неизв. – 1014).
В Антропологическом музее представлены восстановленные образы лидеров национально-освободительного движения Болгарии - Захария Стоянова, Христо Ботева, Георгия Раковского и др.
В экспозиции этого удивительного музея можно увидеть реконструкции могил с характерным расположением в них тел: похороненные в позе зародыша (тип «хоккер») и лежащими на спине со скрещенными на груди руками (по-христиански).