Одним из важнейших музеев города Тарту можно назвать музей Тартуского университета. Он был основан в 1976 году, а его коллекция насчитывает более 70000 экспонатов. Экспозиция музея знакомит с историей университета с момента его основания в 1632 году до наших дней.

В музее Тартуского университета регулярно проводятся выставки, знакомящие посетителей с историей и развитием науки, а также затрагивающие важные проблемы современной общественной жизни. Кроме того, музей проводит различные мероприятия образовательного характера для учащихся самого разного возраста. В распоряжении учреждения есть большой концертный зал и аудитория для проведения конференций.